股票权证和备兑权证的主要区别在于：
1、认股权证发行者是上市公司，而备兑权证发行者是上市公司以外的第三者。
2、认股权证不能创设或增加其流通量，而备兑权证可以进行相关创设增加其流通量。
3、认股权证一般行权时只能是认购股票，而备兑权证则是按权证的类型划分为认购或认沽，认购行权时买入相关股票，认沽行权时卖出相关股票。
4、认股权证到期时只能进行实物交割(交割的是股票)，而备兑权证不一定是实物交割的，也可以用现金进行结算的。
5、认股权证有增加总股本的性质，主要由于相关行权时，上市公司会增加发行该公司的股票来应付行权的需要，而备兑权证没有增加总股本的性质，主要由于是上市公司以外的第三者发行，它不具有增加该上市公司有股本的权利。
